免疫程序不合理、母源抗体干扰、免疫抑制病等都能造成猪瘟免疫失败，其实在我国对猪瘟疫苗的研究已经相对成熟，猪瘟疫苗质量有保证，免疫失败并非都源于疫苗问题。
免疫程序存在缺陷是造成免疫失败的主要原因，目前在规模化猪场对猪瘟的免疫程序众说纷纭，十分混乱。主要表现在对仔猪免疫时间、次数、剂量等方面缺乏指导，制定免疫程序的随意性较大，导致免疫效果极不理想；加大免疫剂量（2～5头份）；此外，采用三次免疫、四次免疫，免疫剂量加大到10头份以上等等。
目前，业界对“乳前免疫”争议比较大，在理论上该方法是可行的。因为猪的多数母源抗体不能通过胎盘进入胎儿体内，初生仔猪体内母源抗体极少，不足以干扰弱毒疫苗与免疫细胞的接触。超前免疫能使弱毒疫苗在体内有足够的增殖时间而不被血液中的母源抗体中和，使仔猪尽早获得主动免疫，但是在实际操作中却难以实施。
母源抗体对初生仔猪有保护作用，但也会影响仔猪的免疫效果。因此在给仔猪使用高质量的疫苗时，能否起良好的免疫效果与母源抗体滴度有关。当母源抗体滴度高时，实施免疫接种，疫苗病毒会被母源抗体中和，不起保护作用。
因此在实施免疫接种前要考虑母源抗体的滴度，同时还要注意母源抗体的整齐度。具体做法是免疫接种前检测母源抗体滴度，调整母源抗体的整齐度，保证空怀母猪猪瘟抗体的水平不低于1：64，分娩母猪猪瘟的抗体水平不低于1：32。对反复接种后抗体水平仍然很低的母猪以及带毒母猪应该彻底淘汰。
此外，日常的饲养管理，营养健康，滥用药物等都能影响免疫效果。
至于如何制定科学的免疫程序，其实没有一成不变方法，有条件的猪场最好根据猪群抗体检测结果来安排免疫时间，如仔猪猪瘟疫苗的首免时间应依据母源抗体的消长来安排。首免前对自猪分周龄采血检测抗体水平，绘制仔猪母源抗体消长曲线，当母源抗体下降至较低水平时注射猪瘟疫苗，既可以尽量降低母源抗体对疫苗的影响，也不会形成免疫空挡。
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