动物类别
动物种类不同，其消化器宫、消化代谢有很大差别，同一种饲料的转化率也不一样。猪是单胃杂食动物。牛羊等是有四个胃的反刍家畜，其中瘤胃里的微生物可利用含粗纤维较多的青粗饲料合成菌体蛋白。马介于猪牛之间，也是单胃。但有发达的盲肠和结肠，也能消化利用含粗纤维较多的青粗饲料。鸡有嗉囊、腺胃和肌胃，但没有牙齿，只靠喙将某些食物撕碎，且肠道短，食物在消化道停留的时间短。因此，各种动物对同一种饲料中的营养物质消化率各不同。如牛羊对粗纤维的消化率达50%~90%，马为40%，猪为2.5%~3%，鸡只能利用精饲料中和优质干草的部分粗纤维，对粗饲料的利用率几乎为零。消化率低，饲料转化率必然低，两者成正比关系。
饲料本身因素
生大豆含抗胰蛋白酶和血凝因子，它们都有抑制蛋白分解酶的作用，使饲料蛋白消化率降低。如经加热处理，有害作用即可消失。
谷实和青饲料含有一种还原性物质，它容易和饲料中氨基酸结合，发生“褐变反应”，生成难以分解的物质，青饲料中的硝酸盐和亚硝酸盐在消化道中会破坏胡萝卜素，妨碍维生素A的形成，并有碍维生素D和维生素E的吸收作用;亚硝酸盐还能破坏血中携带氧的亚铁血红蛋白，造成机体缺氧状态，影响机体的正常消化代谢过程。另外，棉子饼中的棉酚、马铃薯中的龙葵精、菜子饼中的芥子甙等，对饲料中营养物质的消化、吸收都产生不良影响。
饲料加工储藏
同一种饲料因加工方法不同，蛋白质的营养价值也不一样，如机榨的豆饼比溶剂浸提的豆粕含脂肪较多，其含能值较高，而蛋白质含量却比豆粕低;禾本科子实和动物性蛋白质饲料经高温处理，会使蛋白质变性，反而使蛋白质的营养价值降低。
饲料粉碎得过细，使饲料在瘤胃停留的时间缩短，减少了微生物作用于饲料的时间，可降低消化率10%~15%。
饲料储藏时间的延长，常导致饲料中脂肪和维生素等营养物质的破坏，可利用能量的降低幅度可达20%~60%，若是储藏不好，发霉变质，轻的会严重影响适口性和利用率，严重的会导致发生疾病。
在实践中，针对饲料的特性，进行膨化、碱化、氨化等多种方法处理，消化率可提高20%~40%，饲料转化率也会相应提高。饲料配合的科学性各种饲料的营养成分差别很大，没有哪一种饲料能完全满足动物对各种营养物质的需要。在饲养实践中，常把多种饲料搭配饲用。只要配合得当，蛋白质、能量、矿物质元素及各种氨基酸均达到饲养标准要求的平衡状态，就能提高饲料的转化率;相反则必然造成饲料营养物质的浪费。在猪鸡饲料中添加某些必需氨基酸、维生素、矿物质、微量元素就是为了提高饲料转化率。
饲养环境和动物的应激状态
动物所处的饲养环境，如舍温、湿度、光照、空气中有害气体(如硫化氢、氨气等)的含量、运动和休息场所、产蛋箱的多少、食槽的式样或长短、饮水器的足缺、饲料营养的完善程度等和突然变化都会导致动物出现各种异常现象，即应激。重者还会促使发病。比如产蛋鸡在12℃~28℃时产蛋率较高，在21℃~25℃时能保持高产水平，饲料转化率较高;如果经常处于高温状态，易引起蛋壳变薄，长期高于29℃则采食量大减。蛋量大幅度减少，饲料转化率降低。在温度适宜范围内，最佳相对湿度约为60%~65%，如果低于40%，畜禽易诱发呼吸道疾病;如果相对湿度长时间高于72%，畜禽的羽毛会粘连、污秽，关节炎等病也会增多，鸡产蛋率受影响。另外，动物体内外寄生虫等疾病的发生都会对营养物质的消化、吸收有着极其有害的影响。
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