1 、猪早期隐性感染乙型脑炎病毒：如果在每年1-3月份出生的仔猪留作种用，该种猪在6月龄前已受蚊虫叮咬，即受该病毒侵袭，由于种猪体内尚有一定量的抗体存在，抵抗力较强，临床症状不明显，随即痊愈，并获得免疫力。种猪早期即处于隐性感染状态，所以，在6月龄时对该种猪接种乙型脑炎疫苗，效果往往欠佳。
2 、母源抗体干扰作用：留作种用的仔猪其体内的母源抗体可维持5个月，而一般常规免疫都是在每年的4月下旬至5月上旬，如果此时种猪尚未达到6月龄即进行接种免疫，那么，种猪体内的抗体和抗源起中和反应，免疫无效。
3、经产母猪免疫的误区：一般认为经产母猪已经过一次接种免疫，又经过了几次自然免疫（即蚊虫叮咬），母猪已获得了终身免疫，不再作第二次接种免疫，事实上母猪虽然获得了免疫力，但呈隐性感染，随着环境因素的改变，如高温母猪大有厌食，猪舍环境卫生条件差，蚊虫大量叮咬，机体抵抗力下降的情况下，母猪体内病毒的毒力增强，数量增多，经产母猪仍可发病。
4、乙型脑炎接种免疫次数的影响：一般的规模猪场，对该病的接种免疫还没有一个系统的认识，有些资料介绍得也不尽一致。一般对后备母猪都在配种前接种一次乙型脑炎疫苗即可。实际上，猪对此病有较大的易感性，加上传染的必然性及干扰此病免疫效果的因素又多，一次免疫很难收到良好的效果，所以，对初配母猪必须要进行二次接种免疫，对经产母猪每年要接种免疫一次。
5 、乙型脑炎接种时间的影响：由于该病流行具有严格的季节性，所以，在接种免疫的时间上就显得很重要。后备母猪在6月龄时最好在每年的4月下旬-5月上旬，这时为最佳接种免疫期，5月中旬至9月下旬为免疫危险期。10月份达到6月龄的种猪乙型脑炎疫苗可免打，但在次年4月下旬必须对该种猪进行接种免疫，否则造成免疫空白而引发本病。
6、乙型脑炎接种免疫操作方法的影响：由于该病毒对碘很敏感，故在注射部位禁止用碘叮消毒，否则免疫效果不佳。
7、 热应激的影响：猪随着年龄的增长，对冷的耐力提高，但对热的耐受性降低，机体的抵抗力。成年猪对热应激影响较大，采食量、饲料转化率都降低，机体的抵抗力也随即下降。由于该季节蚊虫的大量繁殖，且病毒毒力较强，数量又多，即可诱发此病的发生。
8 、饲养管理条件：饲料的营养水平是否适应母猪高温季节的需求，猪舍温湿度的调控能力，猪舍周围的环境卫生污染程度等都直接或间接地影响该病的发生。
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夏末秋初应慎防猪乙型脑炎，西药尚无特效药物，可以选用中药治疗
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