1、疾病表现复杂，诊断困难
目前，多病原混合感染已成为猪病发生的主要形式，使得临诊表现和病理变化不及单纯感染那么典型，同时，非典型化病例的出现，使得猪病诊断更加困难。临床实践中，猪病诊断方法有流行病学诊断、临诊诊断、病理学诊断、微生物学诊断、血清学诊断及分子生物学诊断。但是，基层兽医常用的方法仍是流行病学诊断、临诊诊断或病理学诊断，有些甚至不会病理剖检，因此，诊断只凭经验，结果可想而知。疾病诊断是治疗的前提，若诊断差之毫厘或错误，治疗则谬以千里。因此，当前猪病治疗难的主要原因之一就是诊断困难。
对策：掌握猪病诊断方法，拓宽疾病诊断思维。在掌握传统诊断方法同时，猪病实验室诊断技术将是今后猪病诊断的重要方向。因此，建议有条件的猪场或兽医门诊最好设猪病诊断实验室，规格不必太高，能进行常规细菌病和寄生虫病诊断，能利用诊断试剂盒、胶体金试纸等进行快速检测即可。
2、混合感染，影响疗效
当前猪病流行特点之一就是多病原引起的混合感染，如细菌与细菌、细菌与病毒、病毒与病毒或与寄生虫等。猪一旦发病，多为混合感染。多重感染带来的后果就是增加了诊断和防治的难度。同种治疗方法在单纯感染和混合感染病例上呈现出的疗效存在差异。原因在于细菌混合共存，其中一些菌能抵御或破坏宿主的防御系统，使共生菌得到保护。更为重要的是混合感染常使抗生素活性受到干扰，体外药敏试验常不能反映出混合感染病灶中的实际情况，故增加了治疗难度。
对策：加强饲养管理，搞好环境卫生，增强猪体抵抗力。正所谓 正气存内，邪不可干 。制定严格的消毒制度，科学选择和使用消毒药。根据当地疾病流行情况和猪场实际情况，制订切实可行的免疫程序，不可盲目照搬。
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