近年来，鄂尔多斯市按照“填平补齐，达标建设”的原则，通过积极争取上级经费，加大市本级和旗区级投入等多种途径，为疾病预防控制机构更新和补充购置监测检测设备。
目前，鄂尔多斯市疾控中心能够检验非食品类154项，食品类132项，生活饮用水106项；通过实验室计量认证的检测项目为16类298项，其中水质检测项目达到106项，食品风险检测达到了67项，并通过了中国疾控中心“中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络(PulseNet China)内蒙古区域网络实验室”认证。所有旗区疾控中心水质检测能力达到了自治区要求的42项。乌审旗疾控中心正在进行新建，伊旗疾控中心改建也已经完成，鄂旗疾控中心新建实验室已经通过审批于4月份开始施工。所有旗区都购置了新仪器，并安装调试完毕，全市疾控机构硬件设施和实验室检测能力大幅提升。
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