养殖粪便的处理方法较多，主要有干燥处理、好氧堆肥、沼气发酵以及饲料利用。
干燥处理。就是粪便脱水以方便使用，主要有自然干燥和高温快速干燥。自然干燥是利用阳光照晒畜禽粪便进行干燥处理;高温快速干燥则是通过干燥机进行人工干燥。我国常用滚筒式干燥机，能使鸡粪的含水量由70%~75%在短时间内下降至8%以下，但存在烘干机排出的臭气二次污染以及处理温度过高导致肥效较差等缺点。
好氧堆肥。畜禽粪便中含有大量的有机物及丰富的氮、磷、钾等营养物质，是农业可持续发展的宝贵资源，因此对粪便进行好氧堆肥是目前广泛使用的处理方式。根据粪便原料和辅料的特性，根据堆肥要求的碳氮比和水分含量，对粪便和辅料按一定比例混合，并对堆体中氧气和温度进行适当控制，使粪便快速发酵生产有机肥。这种方法处理粪便的优点在于最终产物臭气少，且较干燥，容易包装、施用，可作为土壤改良剂或有机肥料应用于农业生产。
沼气发酵。根据畜禽粪便中有机物含量高的特点，在一定的水分、温度(35℃~55℃)和厌氧条件下，通过各类微生物的分解代谢，最终形成甲烷和二氧化碳等可燃性混合气体(沼气)，同时杀灭粪水中大肠杆菌、蠕虫卵等。沼气是清洁能源，可作为燃料用于家庭生活，养殖场大量沼气也可进行发电并网;沼渣沼液中含有氮、磷等成分，可作为肥料用于农业生产、也可用于养鱼、作物浸种等，沼气发酵是我国目前使用较广泛的粪便处理方法之一。
饲料利用。研究证明，畜禽粪便含有大量未消化的粗蛋白、粗纤维、粗脂肪和矿物质等，其中氨基酸的组成也比较齐全、含量也较丰富，经过加工处理后，可杀死病原菌、提高蛋白质的消化率和代谢能、改善适口性，能成为较好的饲料资源。
粪便堆肥具有以下特点：
(1)自身产生一定的热量，并且高温持续时间长，不需要外加热源，即可实现无害化。
(2)使纤维素这种难于降解的物质分解，堆肥物料矿质化、腐殖化，产生重要的土壤活性物质。
(3)基建投资低，易于管理，设备简单。
(4)产品无味无臭、质地疏松、含水率低，便于运输和后续商品肥料加工。
目前，好氧堆肥是养殖场普遍使用的粪便处理方式。
关于畜禽粪便处理的一些小知识
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