随着养猪业的迅速发展，但也暴漏出目前生猪行业滞后的诸多因素，譬如中国种猪市场的相对滞后，与中国作为世界猪肉第一生产大国严重失衡的是，我国的种猪质量却一直没有大的、实质性进展，其原因是非常复杂的，除了中国悠久文化历史形成的独特消费市场和长期计划经济等因素作用外，主要可以概括为以下几点。
第一：缺乏长远的育种眼光和有效组织：长期以来，我国的猪育种工作大多以科研项目的形式进行，缺乏与市场直接联系的经济实体，未获得相应的经济回报。只有直接从事养猪生产的企业，甚至专业的育种公司才有可能组织结构合理的繁育体系，内部协调好各功能群体经营者的利益，建立有效的育种体系。
第二：缺乏系统、持久的育种规划：猪育种工作的长期性和艰巨性是众所周知的，在缺乏长远利益眼光和结构完善的繁育体系情况下，是难以长期执行有效的育种规划的。
第三：育种资金投入不足，缺乏牢固的基础性育种工作：猪育种依赖于长期坚持不懈的性能测定，需要注入大量的资金，积累大量有效的育种数据记录，这是制约我国猪育种工作的决定性因素。长期以来，我国在猪育种方面的投入严重不足，而且实际上投入到猪育种改良方面的资金也大大低于引种投入资金。另一方面，由于养猪生产的小农经济模式，小群体闭锁继代选育成为流行方式，经营规模有限，难以开展具有商品生产价值的育种工作，缺乏有效的育种措施，基本育种资料记录系统不完善，基层种猪场技术力量不足，水平不高。
长久以往，由于诸多因素的共同干扰，导致猪育种工作难以以健康有效的方式进行，养猪企业育种的积极性没有充分调动起来，难以主动在育种方面进行投入，这也是严重滞后我国种猪事业迅速发展必要因素。
可以认为，国内育种界对现代育种理论掌握上与先进国家的差距并不大，所缺乏的是长期坚持育种基础性工作和遗传评估体系，在这方面与发达国家存在着巨大的差距。随着我国养猪产业化的兴起，对优良猪种的需求逐年增加，而且也提出了更高的要求。因此，现代化种猪公司必须集中财力、物力和人力，在原有的基础上，长期不停地对现有种猪资源不断选育，应用现代育种技术(包括生物技术、计算机技术、信息技术和系统工程技术等)进行种猪的遗传改育，加快育种进展，提高选择效率，以不断满足猪种产业化的需求，引领我国养猪业的发展，以达到国内一流和国际领先的水平。
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