益生菌是一类从宿主体内分离的正常有益菌群制成的活菌制剂及微生物发酵产品，在水产养殖中应用比较广泛的有益菌主要有：芽孢杆菌、光合细菌、乳酸菌、硝化细菌以及酵母菌。益生菌因为不会像抗生素一样会产生毒副作用而被广大水产养殖者所青睐，在水产养殖中主要有降解有机质、分解转化有害物质、平衡水体微生态、抑制有害菌群的繁殖、增强养殖动物免疫力、维持藻相平衡等作用，“低产培藻、高产培菌”也由此而来，可见益生素对水产养殖的影响。可是，在实际养殖生产过程中，很多的养殖者并不能合理的运用各种益生菌，而是笼统的下菌种，不能分辨各种益生菌的特点和作用机理，导致益生菌不能物尽其用，甚至在某些情况下还会因使用不当而造成损失，下面我们就各类常见益生菌的特点和作用机理作一简单论述。
芽孢杆菌：芽孢杆菌是一种严格需氧或兼性厌氧的革兰氏阳性菌，在繁殖过程中能分泌大量的蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶，能和池塘内其他微生物共同作用将残饵和养殖动物的排泄物分解成水和二氧化碳，从而净化水体。我们在养殖过程中使用较多的是枯草芽孢杆菌和深海芽孢杆菌，枯草芽孢杆菌可以用水稀释后拌入饲料内服，营造肠道厌氧环境同时促进养殖动物对饲料的利用吸收。值得注意的是芽孢杆菌是耗氧的，所以使用芽孢杆菌一般在池塘不缺氧的晴天上午使用，使用时开增氧机，同时成品的芽孢杆菌处于休眠状态，使用前需用红糖水等有机物活化。
光合细菌：光合细菌是在厌氧条件下进行不放氧光合作用的细菌的总称，是一类没有形成芽孢能力的革兰氏阴性菌，光合细菌在好氧和厌氧环境下均能生长，适宜在PH值6―8之间、温度15℃―40℃的环境中生长。光合细菌能利用小分子有机物和无机氮合成有机氮化物，起到降解氨氮、亚硝酸盐的作用，同时光合菌作为一种饲料添加剂可以提高鱼类生殖率和抗病力，降低饵料系数，从而使养殖综合成本大大降低。但是光合细菌的作用过程是在光合作用下完成的，所以光合细菌在水体中光能见度较低的水层并不能产生良好的效果，同时光合细菌的使用需要注意光照条件，并且由于光合细菌只能利用水体中的小分子有机质，所以在使用过程中必须先用其他微生物将大分子有机质分解为小分子有机质，以便增强光合细菌的利用率。光合菌还可以辅助培养硅藻、小球藻等鱼类喜欢摄食的藻类成为优势藻，而蓝藻等有害藻类受到抑制，使水体更稳。水产养殖中使用的较为常见的光合细菌是沼泽红假单胞菌。
乳酸菌：乳酸菌是一类以碳水化合物为原料发酵产生乳酸的细菌的统称，大部分属于耗氧菌。乳酸菌可利用水产动物肠道内的有机物进行生长繁殖，同时消耗肠道内氧气，在肠道内形成厌氧环境，并且产生大量有机酸降低肠道PH从而维护肠道内菌群平衡抑制有害菌的生存繁殖。乳酸菌在其生长繁殖过程中还可以分泌乳酸、过氧化氢等对有害菌有杀灭或拮抗作用的物质，从而治疗某些肠道疾病。乳酸菌亦可作为养殖水体的“水质调控剂”，调节藻相平衡，抑制有害菌类，有效降低水体中氨氮、亚硝酸盐的含量。
硝化细菌：硝化细菌是一种化能自养型好氧细菌，主要应用于降低水体氨氮和亚硝酸盐的过程中。硝化细菌可以将离子态铵转化成亚硝酸根离子进而转化成对水生动物无毒硝酸根离子，起到降氨氮、亚硝酸盐的作用，但是硝化细菌生长繁殖慢，好氧，在有机质过多、PH值低、温度低、溶氧低的环境中并不能良好的繁殖，所以使用硝化细菌应注意使用时水体的情况，同时硝化细菌不可与化学增氧剂如过碳酸钠、过氧化钙等同时使用，因为他们分解释放出的氧化性较强的氧原子会杀死硝化细菌。
酵母菌：酵母菌属于兼性厌氧微生物，是喜生长在偏酸性环境（pH值3―7.5）中的需氧菌,可以在消化道内大量繁殖。酵母菌可以利用水中的氨态氮、淀粉、有机酸、硫化氢等物质作为自身生长的营养，大量繁殖，在与有害菌的生存竞争中成为优势菌群，抑制有害菌的生长；同时酵母菌内服还可以粘附在肠道中，刺激养殖动物体内淀粉酶等物质的分泌，提高养殖动物对饵料的利用率。
水产益生菌在净化水质、提高水产养殖抗病能力、提高饲料转化率等方面发挥着明显的作用，但在如何充分发挥水产益生菌的功效等方面，还需要养殖者更好的掌握、完善和应用，注意一些使用技巧如光合细菌对亚硝酸盐转化率低、芽孢杆菌对氨氮转化率低等，充分合理的利用水产益生菌。
总之，在水体中或饲料中及时补充适宜的益生菌，一方面可以起到养殖者想要的特殊效果，另一方面当水体中有益菌形成优势种群后，有害菌的生长繁殖自然会被抑制，从而降低细菌性疾病的发病率，增加养殖者的养殖效益，切不可平时不补或少补，病时乱补滥补！
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