种蛋入孵前，要认真检查孵化室的密封、保温、通风条件，对孵化室、器具等进行全面消毒。开机试温、预热2～3天后即可入孵。
(1)孵化的条件
主要包括温度、湿度、通风条件的控制。
①温度孵化室温度为21—23℃，孵化机内的温度为36.4～36.6℃，出雏机内的温度为36.1—36℃。要视天气情况，进行调节。
②湿度孵化机内的相对湿度应控制在23%～27%范围内较适宜，晴天可高些，雨天可适当低些。出雏机内相对湿度控制在25%—30%范围内。
③通风通风在鸵鸟种蛋的孵化过程中很重要，尤其是孵化后期。
④翻蛋每隔2～3小时翻蛋一次，翻蛋角度以90"～110。为宜。
孵化期的管理
①环境控制鸵鸟孵化期为42天，孵化中前期温度恒定在36.8℃；孵化后期30～42天，胚胎自身产生大量的热，需要的温度相对较低，以36℃为宜。孵化要求的湿度较低，孵化器内相对湿度一般为20%～40%。孵化室内环境相对湿度在40%时，基本不用加湿。
②照蛋第一次照蛋是在八孵时进行，检查种蛋气室是否朝上。第二次照蛋是在入孵的第12天，可见到清晰的血管，能见到头部和躯干部两个小圆团，称为“双珠”。入孵第34天进行第三次照蛋，此时看不见血管，蛋的小头端胚胎充满，称为“封门”。
③翻蛋鸵鸟蛋孵化期内一般每2小时翻蛋1次，40夭转入出雏器后停止翻蛋。据研究，如果翻蛋角度增大到50"～55"，会促进胚胎发育和血液循环，使孵化率有所提高。
④落盘与出雏鸵鸟胚胎孵化到40天由孵化器移到出雏器为落盘。如胎位正常，头在趾的上方，小鸟喙破蛋膜进入气室，约12小时就可自行出壳。可在脐带端涂碘酒消毒，然后用灭菌的纱布包扎。如果小鸟啄破蛋膜进入气室，12小时还未啄破蛋壳，就要在气室的顶端打一小孔，以供给小鸟充足的氧气，并逐渐剥掉顶部的蛋壳，让小鸟自行出壳。
⑤雌雄鉴别进行雌雄鉴别有利于分群饲养和营养配给。雏鸵鸟的雌雄鉴别多采用翻肛法，看是否有向左弯曲的阴茎。15月龄以前的鸵鸟很难从外表上区别雌雄，因此．雏鸵鸟的雌雄鉴别要进行几次，一般在1同龄、2月龄、3月龄分别进行鉴定。
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